Le fil

visNetwork, le package R qui optimise la Visualisation dynamique des Réseaux

R&D - 24 décembre 2018

Développé et partagé en open source par Datastorm, visNetwork est téléchargé en moyenne 1000 fois par jour.

Dans le monde académique, celui de la recherche ou dans les entreprises qui traitent de la donnée, R est devenu l’un des langages de programmation incontournables. Sous licence GNU GPL, multi-plateforme et multi-OS, R bénéficie d’une large communauté de contributeurs dont l’activité n’a cessé de croître ces dernières années, portée notamment par les applications en machine learning.

Grâce aux « packages », les contributeurs peuvent en effet partager leurs propres développements de R. « Un package contient un ensemble de fonctions, leur documentation, des tests unitaires, et de plus en plus des applications shiny, le tout en gérant les éventuelles dépendances à d’autres packages … » explique Benoit Thieurmel, directeur des opérations de Datastorm et contributeur R. Le site RDocumentation.org recense ainsi plus de 15 000 bibliothèques disponibles en open source sur les projets Comprehensive R Archive Network (CRAN), Github ou encore Bioconductor.

 

Des solutions et des algorithmes innovants

Datastorm développe et partage régulièrement des composants sur ces plateformes, dont plusieurs packages R comme visNetwork, une interface entre R et la librairie vis.js qui permet une visualisation dynamique des réseaux. Facilement configurable, manipulable directement depuis R Shiny, visNetwork est notamment utilisé en biologie et en génomique.  (voir les articles : Digging into the low molecular weight peptidome with the OligoNet web server et Unraveling the evolution and coevolution of small regulatory RNAs and coding genes in Listeria, publiés sur le site du National Center for Biotechnology Information).

Largement reconnu, visNetwork, mis en ligne en 2015, est téléchargé en moyenne 1000 fois par jour depuis le CRAN RStudio. Ce partage de R&D qui profite aux chercheurs mais aussi à tous les acteurs de la Data Science, Benoit Thieurmel y est très attaché : « c’est ce qui nous permet de rester en alerte et de proposer des solutions et des algorithmes innovants et performants ».

 

Les + de visNetwork
• Interactions variées et facilement configurables pour une lecture simplifiée
• Utilisation d’images et d’icônes web possible
• Visualisation des arbres de classification et de régression
• Des dizaines de méthodes disponibles pour manipuler le réseau directement depuis Shiny (ajout/suppression de données, zoom, déclenchement d’événements…)
• Groupements de nœuds, simples ou multiples
• Passerelle vers le package igraph

 

visNetwork sur Github
http://github.com/datastorm-open/visNetwork

Documentation :
http://datastorm-open.github.io/visNetwork/

 

 

Insuffisance rénale : Datastorm a développé une application dédiée aux équipes médicales

Datastorm a développé une application qui permet aux équipes médicales de générer facilement des statistiques et indicateurs relatifs aux patients traités par dialyse à domicile. Un projet au service de la santé piloté par le Docteur Christian Verger, président et co-fondateur du Registre de Dialyse Péritonéale de Langue Française & Hémodialyse à Domicile. Interview.

Comment concilier Performance Business et Réglementation grâce à l’Anonymisation des données ?

Jeudi 24 septembre 2020 – 11h Lors de ce webinar, nous étudierons un cas concret d’anonymisation. Nous développerons la recherche d’un équilibre entre maîtrise des risques de fuites d’informations et conservation des capacités d’analyse. En lien avec notre Livre Blanc publié début septembre, nous verrons comment mettre en œuvre la méthode de la k-anonymisation. Nous verrons ensuite comment […]

R&D
Livre Blanc Datastorm : Déployer une procédure d’Anonymisation

Dans ce Livre Blanc, nous établissons les bases permettant de déployer une procédure générique et rigoureuse d’anonymisation : comment valoriser des données en respectant les contraintes imposées par le RGPD ? Comment préserver les données à caractère personnel ou sensibles de vos clients et collaborateurs sans réduire vos capacités d’analyse ? Comment auditer vos procédures d’anonymisation pour vous prémunir des risques juridiques ?

Toute l'expertise du Groupe ENSAE-ENSAI

Plateau de Saclay
5 Avenue Henry-Le-Chatelier
91120 PALAISEAU - FRANCE

Paris
24 rue Barbès
92120 MONTROUGE - FRANCE